W latach 2012–2022 Paul Daniel był I dyrygentem i dyrektorem artystycznym Real Filharmonía de Galicia, natomiast w latach 2013–2021 był dyrektorem muzycznym Orchestre National de Bordeaux Aquitaine. To samo stanowisko sprawował w West Australian Symphony Orchestra (Perth) w latach 2009–2013.

Występował jako gościnny dyrygent z najważniejszymi orkiestrami i zespołami operowymi na całym świecie. W latach 1997–2005 był dyrektorem muzycznym English National Opera; w latach 1990–1997 był dyrektorem muzycznym Opera North i I dyrygentem English Northern Philharmonia; a w latach 1987–1990 dyrektorem muzycznym Opera Factory (Australia).

Jako dyrygent gościnny występował m.in. w Royal Opera House Covent Garden (Londyn), La Monnaie / de Munt (Bruksela), Bayerische Staatsoper (Monachium), Semperoper w Dreźnie oraz Metropolitan Opera w Nowym Jorku.

Ponadto prowadził następujące orkiestry: London Philharmonic, OAE (z którą nagrał Eliasza dla wytwórni Decca), City of Birmingham Symphony Orchestra, Academy of Ancient Music, Orchestre de Paris, Bavarian Radio Symphony Orchestra, Gürzenich-Orchester Köln, Leipzig Gewandhaus, Netherlands Radio Philharmonic, Real Filharmonia de Galicia, Orchestre National Bordeaux Acquitaine, Tampere Philharmonic, Cleveland Orchestra, Milwaukee Symphony, New York Philharmonic oraz Los Angeles Philharmonic.

Wśród jego niedawnych i nowych realizacji operowych są Lukrecja Borgia i Wesele Figara (English National Opera), Gloriana (Covent Garden), nowe dzieło Judith Weir (dla Bregenz Festival i Covent Garden), Lulu (La Monnaie . de Munt, Bruksela), Dziecko i czary oraz Der Zwerg ( Opéra National de Paris), Les Troyens (Deutsche Oper Berlin), Jaś i Małgosia (Zurych), A Village Romeo and Juliet (Oper Frankfurt), Werther (New National Theatre Tokyo), światowa prapremiera The Thirteenth Child Poula Rudersa (Santa Fe) oraz Elektra, Tristan i Izolda i Walkiria (Bordeaux).

Poza działalnością w Bordeaux jego współpraca z orkiestrami obejmuje koncerty z Bavarian Radio Symphony Orchestra, DSO Berlin, BBC Philharmonic, Royal Philharmonic, Hamburg Symphony, Munich Rundfunkorchester, Australian National Academy of Music, National Youth Orchestra of Great Britain oraz podczas Bregenz Festival.

W sezonie 2022/23 powrócił do Bordeaux, aby poprowadzić Madame Butterfly, przygotował nową inscenizację Czarodziejskiego fletu dla Welsh National Opera oraz nad La Princesse de Trébizonde Offenbacha z London Philharmonic dla Opera Rara. Nagranie to zostało niedawno zostało wydane na płycie CD i zdobyło wiele nagród.

W sezonie 2024/25 Paul Daniel poprowadził Wesele Figara w Philharmonie de Paris, powrócił też do DSO Berlin oraz na The Grange Festival, gdzie dyrygował Zemstą nietoperza Straussa.

Kolejnym projektem przygotowywanym dla Opera Rara będzie nagranie oraz koncertowe wykonanie Barkoufa Offenbacha z Halle .

Liczne nagrania artysty obejmują niezwykle udaną płytę CD z III Symfonią Elgara wydaną przez Naxos oraz stale powiększającą się dyskografię z Orchestra National de Bordeaux Aquitaine, obejmującą między innymi płyty z dziełami Wagnera, Mahlera i Czajkowskiego.

Jego nagranie Lulu dla La Monnaie, z Barbarą Hannigan w roli tytułowej, otrzymało wiele nagród.

W 1998 roku Paul Daniel został nagrodzony Olivier Award za wybitne osiągnięcia w dziedzinie opery, a w 2000 roku został odznaczony Orderem Imperium Brytyskiego (Commander of the Order of the British Empire)  w ramach noworocznej listy odznaczeń.